参考答案

(1)人民法院确定的债权人申报债权的期限不合法。根据规定，债权申报期限自人民法院发布受理破产申请公告之日起计算，最短不得少于30日，最长不得超过3个月。在本题中，拟定的债权申报期限为4个月。
(2)①对A的异议不成立。根据规定，附利息的债权自破产申请受理时停止计算。在本题中，A的债权在破产申请受理之前产生的利息可以申报。②对B的异议不成立。根据规定，主债务人破产，保证人提供连带责任保证的，债权人有权直接要求连带保证人清偿保证债务;债权人也可以先向进入破产程序的债务人追偿(申报债权)，再以未受偿的余额向保证人追偿。③对C的异议不成立。根据规定，未到期的债权，在破产申请受理时视为到期。④对D的异议不成立。有担保的债权也应当申报。
(3)甲公司可以拒绝D的要求。根据规定，在重整期间，对债务人的特定财产享有的担保权暂停行使。
(4)甲公司的做法合法。根据规定，在重整期间，债务人或者管理人为继续营业而借款的，可以为该借款设定担保。
(5)人民法院批准重整计划的做法不符合规定。根据规定，有财产担保的债权人将获得全额清偿，其因延期清偿所受的损失将得到公平补偿，并且其担保权未受到实质性影响的情况下，人民法院可以强制批准该重整计划。在本题中，有财产担保的债权人因延期清偿所受的损失未得到公平补偿，人民法院不得强制批准该重整计划。
(6)甲公司不能请求一般债权人返还已经清偿的款项。根据规定，人民法院裁定终止重整计划的，债权人因执行重整计划所受的清偿仍然有效，债权人未受清偿的部分作为破产债权。