参考答案

该公司制定的内部控制系统存在以下缺陷：
(1)《企业内部控制应用指引第1号一组织结构》明确提出要求：企业应当根据国家有关法律法规的规定，明确董事会、监事会和经理层的职责权限、任职条件、议事规则和工作程序，确保决策、执行和监督相互分离，形成制衡。同时强调，企业的重大决策、重大事项、重要人事任免及大额资金支付业务等(即通常所说的“三：重一大”)，应当按照规定的权限和程序实行集体决策审批或者联签制度；任何个人不得单独进行决策或者擅自改变集体决策意见。该公司规定重大资产处置、对外投资和资金调度等事宜统一由总经理审批，不符合《企业内部控制应用指引第1号一组织结构》的要求。
(2)按照《企业内部控制应用指引第9号一销售业务》的要求，办理销售、发货、收款三项业务的部门应当分设，不得由同一部门或个人办理销售与收款业务的全过程。销售与收款属于不相容岗位，该公司规定允许公司销售部门及销售人员直接收取货款，违背了不相容职务分离控制的要求。
(3)按照《企业内部控制应用指引第12号一担保业务》的要求，企业应当加强对子公司担保业务的统一监控，企业内设机构未经授权不得办理担保业务；企业为关联方提供担保的，与关联方存在经济利益或近亲属关系的有关人员在评估与审批环节应当予以回避。该公司规定允许分公司自行决定是否对外提供担保，属于授权不当。