（1）案例中整个外包方案由研发中心制定不符合内控规定，企业应当根据年度生产经营计划和业务外包管理制度，结合确定的业务外包范围， 拟订实施方案，按照规定的权限和程序审核批准。总会计师或分管会计工作的负责人应当与重大业务外包的决策。

（2）案例中在承包商的选择过程中，洪城医药的研发总监推荐了其同学创办的申力科技公司，董事长当即敲定了申力科技为承包商不符合内控要求。企业应当引入竞争机制，遵循公开、公平、公正的原则，采用适当方式，择优选择外包业务的承包方。

（3）案例中并没有就研发进程切实的跟进，导致外包研发周期比预计周期晚了6个月的时间不符合内控要求，企业应当做好与承包方的对接工作，加强与承包方的沟通与协调，及时搜集相关信息，发现和解决外包业务日常管理中存在的问题。