参考答案

首先，“承包单位可以指示分包商采取必要的措施来加快进度”对总承包公司不利，因为分包单位可以据此条款采取增加人员、加班加点或其他必要措施保证合同进度，但因此会向总承包公司提出额外的费用补偿要求。

其次，对于分包单位的误期损失，总承包公司扣除部分费用作为处罚金对总承包公司不利，因为分包单位延误工期造成的误期损害，总承包公司应当从商定的价格中扣除部分费用作为误期损害赔偿，不能作为罚金，否则分包单位将反告总承包公司处以罚款的违法责任。