参考答案

在汇算清缴企业所得税时存在的不合法之处：
①企业债券利息收入属于应税收入，不应调减应纳税所得额。根据规定，国债利息收入属于免税收入，企业债券利息收入属于应税收入。在本题中，应调减应纳税所得额25万元。
②向某商场借款1000万元而发生的利息支出71万元，不得全部在税前扣除。根据规定，非金融企业向非金融企业借款的利息支出，不超过按照金融企业同期同类贷款利率计算的数额的部分，准予扣除。在本题中，利息支出税前扣除限额=1000×6.1%=61（万元），利息支出实际发生额超过了税前扣除限额，应调增应纳税所得额=71-61=10（万元）。
③广告费和业务宣传费不得全部在税前扣除。根据规定，企业发生的符合条件的广告费和业务宣传费支出，除国务院财政、税务主管部门另有规定外，不超过当年销售（营业）收入15%的部分，准予扣除。在本题中，广告费和业务宣传费税前扣除限额=（5950+58÷1.13）×15%=900（万元），广告费和业务宣传费实际发生额超过了税前扣除限额，应调增应纳税所得额=750+186-900=36（万元）。
④业务招待费应调增应纳税所得额的计算有误。根据规定，企业发生的与生产经营活动有关的业务招待费支出，按照发生额的60%扣除，但最高不得超过当年销售（营业）收入的5‰。在本题中，业务招待费扣除限额1=6000×5‰=30（万元），业务招待费扣除限额2=55×60%=33（万元），在税前准予扣除的业务招待费为30万元，业务招待费实际发生额超过了税前扣除限额，应调增应纳税所得额=55-30=25（万元）。
⑤补充养老保险费应调增应纳税所得额的计算有误。根据规定，企业为本企业任职或者受雇的全体员工支付的补充养老保险费，在不超过职工工资总额5%标准以内的部分，在计算应纳税所得额时准予扣除。在本题中，补充养老保险费税前扣除限额=560×5%=28（万元），补充养老保险费实际发生额超过了税前扣除限额，应调增应纳税所得额=62-28=34（万元）。
⑥公益性捐赠支出不得全部在税前扣除。根据规定，企业发生的公益性捐赠支出，在年度利润总额12%以内的部分，准予在计算应纳税所得额时扣除。在本题中，公益性捐赠支出税前扣除限额=600×12%=72（万元），公益性捐赠支出实际发生额超过了税前扣除限额，应调增应纳税所得额=85-72=13（万元）。
⑦税收滞纳金6万元不得在税前扣除。根据规定，税收滞纳金不得在税前扣除，应调增应纳税所得额6万元。