参考答案

上述投标中，无效投标有：

（1）C公司单独投标无效。理由是，C公司和D公司已经组成了联合体投标，就不能再单独进行投标了。相关法规规定，在同一个工程项目的投标过程中，同一个单位不能以不同的身份出现在投标者的名单中，以保证投标者身份的唯一性和投标的公平公正。

（2）E公司的投标报价高于限价，投标无效。理由是，在投标前，业主进行公开招标并对工程招标设立了最高限价，所有投标者应该符合业主的招标文件，不能违背招标文件的要求。E公司的报价高于业主的限价，就是违背了招标文件的要求，从而导致E公司的投标无效。