参考答案

(1)甲公司和乙公司受同一主体(丙公司)的控制，属于一致行动人，其所持有的股份应当合并计算。当其通过证券交易所的交易分别持有丁上市公司1%、4%的股份后，应当在该事实发生之日起3日内编制权益变动报告书，向中国证监会、证券交易所提交书面报告，抄报该上市公司所在地的中国证监会派出机构，通知该上市公司，并予公告。
(2)甲公司不得发出收购丁上市公司部分股份的要约。根据规定，收购人为终止上市公司的上市地位发出要约的，应当为全面要约。
(3)甲公司拟订的收购期限符合法律规定。根据规定，收购要约的期限不得少于30日，并不得超过60日，但是出现竞争要约的除外。
(4)A公司要求甲公司继续以收购要约同等的条件收购其股票合法。根据规定，收购期限届满，被收购公司股权分布不符合上市条件的，该上市公司的股票应当由证券交易所依法终止上市交易;其余仍持有被收购公司股票的股东，有权向收购人以收购要约的同等条件出售其股票，收购人应当收购。在本题中，收购完成后，丁公司公开发行股份的比例已经低于25%，不符合上市条件。