参考答案

乙公司可以维修费用抵销40000元租金。根据规定，承租人在租赁物需要维修时可以要求出租人在合理期限内维修。出租人未履行维修义务的，承租人可以自行维修，维修费用由出租人负担。当事人互负到期债务，该债务的标的物种类、品质相同的，任何一方可以将自己的债务与对方的债务抵销，但依照法律规定或者按照合同性质不得抵销的除外。本题中，租赁楼房的部分门窗自然损坏，丙公司一直未履行维修义务，乙公司自行找某装修企业维修的费用40000元应当由出租人丙企业负担，应由丙企业负担的维修费用和乙企业欠付的租金均为金钱债务，且均已到期，因此乙公司可以以维修费用抵销40000元租金。