选项D正确：全国股份转让系统挂牌的材料制作阶段的主要工作包括：

（1）召开董事会、股东大会，审议通过申请在全国股份转让系统挂牌的相关决议和方案；

（2）制作挂牌申请文件。会计师事务所、律师事务所等中介机构完成相应的审计和法律调查工作后，项目小组复核《资产评估报告》《审计报告》《法律意见书》等文件；主办券商制作《股份报价转让说明书》《尽职调查报告》及工作底稿等申报材料；

（3）主办券商内核。主办券商内核会议审议拟挂牌公司的书面备案文件并决定是否向全国股份转让系统推荐挂牌。发现拟挂牌公司存在仍需调查或整改的问题，提出解决思路；同意推荐目标公司挂牌的，向全国股份转让系统出具《推荐报告》；

（4）向全国股份转让系统报送挂牌申请及相关材料。