参考答案

甲方案：
2010—2015年公司总部缴纳所得税总额＝（1 000＋1 100＋1 200＋1 300＋1 400＋1 500）×25%＝1 875（万元）
分支机构采取子公司形式，所以需要纳税。
根据公式“应交企业所得税＝应纳税所得额×所得税税率”以及“应纳税所得额为负数时不需要缴纳所得税”可知：
分支机构2010—2015年累计应缴纳的企业所得税税额＝（200＋200＋300＋300＋400）×15%＝210（万元）
甲方案下公司总部和分支机构共计纳税＝1 875＋210＝2 085（万元）
乙方案：
分支机构采取分公司形式设立，不具备独立纳税人条件，需要汇总到企业总部集中纳税。
2010—2015年公司总部和分支机构合并后应纳税所得额分别为：（1 000－1 000）、（1 100＋200）、（1 200＋200）、（1 300＋300）、（1 400＋300）、（1 500＋400），即分别为：0万元、1 300万元、1 400万元、1 600万元、1 700万元、1 900万元。
2010—2015年公司总部和分支机构纳税总额＝（1 300＋1 400＋1 600＋1 700＋1 900）×25%＝1 975（万元）
丙方案：
2010年公司总部及分支机构并合并纳税，所以，
两者应缴纳的所得税＝公司总部应缴所得税＝（1 000－1 000）×25%＝0（万元）。
2011—2015年公司总部和分支机构各自单独缴纳企业所得税：
2011—2015年公司总部应缴纳的企业所得税＝（1 100＋1 200＋1 300＋1 400＋1 500）×25%＝1 625（万元）
2011—2015年分支机构应缴纳的企业所得税＝（200＋200＋300＋300＋400）×15%＝210（万元）
丙方案下应缴的企业所得税总额＝1 625＋210＝1 835（万元）
所以三个方案中，丙方案缴纳的所得税最少，为最佳设置方案。