参考答案

不合法问题一:该项目的建设单位强令指示B和C单位组成联合体投标;
理由:《招标投标法》规定,招标人不得强制投标人组成联合体共同投标,排斥了其他投标人可能的中标机会。
不合法问题二:建设单位向B单位暗示;
理由:招标人不得与投标人存在串通行为,属不正当竞争行为。
不合法问题三:B单位与建设单位签订了《建设工程施工合同》;
理由:联合体中标的,联合体各方应当共同与招标人签订合同。
不合法问题四:B和C单位中标后签订部分工程承包协议;
理由:联合体各方应当在投标前签订共同投标协议,明确约定各方拟承担的工作和责任,并提交给招标人。而不是事后签订部分工程承包协议。