自考本科行政管理和自考专科行政管理的主要区别在于学习内容和学习深度。自考本科行政管理是一个更为全面和深入的学科，涵盖了更广泛的理论和实践知识，包括行政组织、行政法律、行政伦理、行政决策、行政管理等方面的内容。而自考专科行政管理则更加注重基础知识和实践技能的培养，主要涉及行政管理的基本原理、方法和技能等方面的内容。

此外，自考本科行政管理的学习时间和学习难度也相对较高，需要学生具备更强的自学能力和学习能力，而自考专科行政管理则相对更为简单和容易，更适合初学者和需要快速提升职业技能的人群。