您好！关于您提出的问题，这里有一个详细的解答。

根据我国现行税法规定，进项税额的抵扣与销售情况有一定的关联。以下是针对您的具体情况的分析：

1. **进项税抵扣原则**：
- 进项税是指企业购进货物、接受服务所支付的增值税，这部分税额在一定条件下可以抵扣企业销售应税货物、服务时产生的销项税。
- 通常情况下，进项税抵扣的前提是货物或服务用于生产应税货物、劳务或者销售应税服务。

2. **免税药品与应税药品的销售**：
- 如果您制造的免税药品和应税药品在销售过程中没有全部卖出，这涉及到进项税额的分配问题。
- 根据税法，不能将用于免税项目的进项税额抵扣应税项目的销项税额。

3. **进项税额的确定与抵扣**：
- **方法一：按实际销售比例分配**。可以将购进的货物和服务按照免税药品与应税药品的实际销售比例分配进项税额。即，只有与应税药品销售相关的进项税额可以用来抵扣应税药品的销项税。
- **方法二：采用合理的方法预估**。如果尚未销售，可以根据以往的销售数据或者市场预估来合理分配免税药品和应税药品的进项税额。

4. **不需要全卖完才能抵扣**：
- 没有要求必须等到所有药品都卖完后才能抵扣进项税额。一旦可以明确应税药品的销售情况，就可以根据实际销售情况来抵扣相应的进项税额。

5. **注意事项**：
- 企业需要保存好相关票据和记录，以证明进项税额的合理性、准确性。
- 建议在进行税务处理时咨询专业的税务顾问或税务机关，确保符合最新的税法规定。

希望以上信息能够帮助到您，如果还有其他问题，欢迎继续咨询！祝您工作顺利！