南京财经大学会计研究生是南京财经大学规模最大、办学历史最为悠久的院系之一。
早在1962年就设立了财会专业。1981年成立会计系并开始招收财务会计专业本科生，系江苏省第一个会计本科专业点。2000年，在原南京经济学院、江苏财经高等专科学校和江苏省经济干部管理学院三校会计系的基础上合并重组为。
目前学院设有会计学、财务管理、审计学、资产评估4本科专业，拥有会计学学术型硕士授权点、会计专业硕士（MPAcc)和资产评估硕士（MV)两个授权点。
近60年来，经过几代人的不懈努力，南京财经大学在教学、科研、社会服务、国际交流等方面取得了广泛的社会认同度和美誉度，已成为长三角乃至全国有较高影响力的之一。学院依托江苏高校优势学科（工商管理优势学科）和江苏高校协同创新中心（现代服务业协同创新中心），以授予博士学位的服务国家特殊需求人才培养项目为产学研一体化的引领平台，全面深化专业教学的综合改革，在专业建设方面取得了显著成效。会计学专业是教育部特色专业、江苏省重点专业、江苏省首批品牌专业；财务管理、审计学、资产评估是江苏省“十二五”重点专业类建设项目；2018年会计学专业获得江苏省高校品牌专业建设一期工程A级资助；会计信息实验中心是江苏省高等学校实验教学示范中心，也是国家级经济管理实验教学示范中心的重要组成部分。
南京财经大学会计学院基于国家及地方经济社会发展需求、高等教育改革要求和学院自身的办学条件与优势特色，明确了办学定位。