两者所包含的金融市场种类确实是有重合的，但从涵义而言，这两者并没有很强的可比性，因为两者并不是按同一标准划分出来的两个市场。与资本市场可比的是货币市场，两者的划分标准是其各自市场中的金融产品的流动性，包含流动性强的金融产品的市场为货币市场，如货币市场基金、隔夜拆借市场等，而流动性较弱的金融产品所在的市场为资本市场，如股市、债券和期限较长的基金市场等。
证券市场是资产标的物以证券形式存在的市场的统称，无论是资本市场还是货币市场中的金融产品，只要是以证券形式存在的产品，都可以说属于证券市场。但资本市场或货币市场中的金融产品并不一定全是以证券形式存在的，如中长期信贷（包括各种中长期存贷款），存在于银行系统，并不属于证券市场和证券系统，而从其资产流动性来讲，其流动性较弱因此属于资本市场产品。又比如活期存贷，其流动性很高故属于货币市场工具，但并不属于证券市场。
简言之，资本市场中的金融产品可能属于证券市场，也可能不属于证券市场；货币市场中的金融产品可能属于证券市场，也可能不属于证券市场；证券市场中的金融产品可能属于资本市场，也可能属于货币市场。因此，资本市场不等于证券市场，资本市场+货币市场>证券市场。