您好！关于您提出的问题，差额的处理方式在会计上是有明确规定的。以下是对这一情况的详细解释：

1. **资本公积的概念**：
资本公积是指企业在股票发行、资产评估增值等非经营性活动中形成的，按照规定不能分配为利润的积累资金。

2. **差额产生的原因**：
在您的问题中，正常发行股票会产生3340的资本公积，但计入长期股权投资的资本公积只有3000，这种差额可能是由于以下原因：
- 股票的发行价格高于面值部分计入资本公积，但实际计入投资的资本公积可能包含了其他因素，如评估增值等。
- 可能涉及到会计政策的选择或特定的会计处理规则。

3. **差额的处理方法**：
根据会计准则，剩余的340（3340-3000）通常可以这样处理：
- 如果是由于股票发行产生的溢价收入，且这部分溢价未完全计入长期股权投资，那么剩余的部分应该保留在“资本公积-股本溢价”账户中。
- 如果差额是由于会计处理或政策选择导致的，需要根据实际情况和会计准则进行调整，可能涉及以下几种方式：
- 调整当期损益：在符合条件的情况下，可以计入当期的营业外收入或其他收入。
- 调整其他相关账户：如果涉及多个会计科目，需要根据具体业务和会计准则进行调整。

4. **会计分录**：
- 发行股票时的分录可能是：借记“银行存款”等科目，贷记“实收资本”和“资本公积-股本溢价”。
- 计入长期股权投资的分录可能是：借记“长期股权投资”，贷记“资本公积-长期股权投资溢价”。

5. **建议**：
对于具体的会计处理，建议与您的财务顾问或会计人员沟通，确保所有会计处理都符合当前的会计准则和法规要求。

希望上述回答能够帮助您解决问题，如果您还有其他疑问，欢迎继续提问！祝您工作顺利！