微生物质量工程师是负责设计、开发和优化微生物相关的生产工艺和生产线的专业人员。他们使用微生物学、生物化学、分子生物学、生物工程等学科的知识和技术，开发出能够大规模生产微生物制品（如药品、食品、饲料、化学品等）的工艺流程，并进行质量控制和质量保证，以确保产品符合规定的质量标准和生产效率要求。此外，微生物质量工程师还需要关注生产环境的卫生和安全问题，并制定相应的安全措施和应急预案。