我来回答一下吧，不同之处有，

一、持证人内容不同：

1、卫生保健专业毕业，医师资格考试合格取得执业助理医师资格的人员应当在乡、村两级医疗机构执业。卫生行政部门应在其《医师资格证书》和《医师执业证书》的持证人“姓名”上方空白处加盖红色标识章。标识章全国统一格式，内容为“乡村”。

2、初中起点五年制大专临床医学专业毕业，医师资格考试合格取得执业助理医师资格的人员，在乡、村两级医疗机构进行执业注册，取得《医师执业证书》，并执业满5年后，可以申请到县级医疗机构执业。

也可以继续在乡、村两级医疗机构执业。卫生行政部门应在其《医师资格证书》和《医师执业证书》的持证人“姓名”上方空白处加盖红色标识章，内容为“乡村5年”。 

二、考试类型不同：

1、乡村助理医师由县级人民政府卫生行政主管部门应当进行有关预防、保健和一般医疗服务基本知识的培训，并根据省、自治区、直辖市人民政府卫生行政主管部门确定的考试内容、考试范围进行考试。

2、乡镇执业助理医师资格考试（盖五年章）与国家医师资格考试统一组织，单独命题，单独划定合格线，考试合格发给执业助理医师资格证书，限定在乡镇卫生院执业。