发证机关不同。
首先，也是最重要的区别，两证书的发证机关不同。“劳动证”由原国家劳动部颁发；“注册证”则是由现在的国家人力资源和社会保障部、国家住房与城乡建设部两大部委（实际上是原劳动、人事、建设三部委）共同颁发，这也就决定了“注册证”是有国家的劳动监察部门、人事及职称管理部门、物业管理行业管理部门三个与行业和行业用工关系最为紧密的部门共同颁发的，显然也就使得“注册证”成了无可厚非的含金量最高的行业证书。