五年制检验本科原则是可以报考的。在2002年有个教育部和卫生部发的文件中是专门提到医学检验本科列为医学类，规定可以报考执业医师，后来就好象卫生部开会讨论检验医师的设置问题。讨论检验本科别业生是否满足检验医师的能力。04年的时候执业医师资格考试报考规定中就明确规定“四年制医学检验”不能参加执业医师考试了，到2006年的执业医师资格考试报考规定基础医学类、法医学类、护理学类、辅助医疗类、医学技术类等相关医学类和药学类、医学管理类毕业生不可以报考执业医师。具体解释的时候将医学影像技术、医学检验技术规定为技术类。没有具体规定医学检验是否属于技术类。所以执行政策的时候大部分省份把五年制医学检验视作医学类可以报考。四年制的属于技术类。有的省份是为了图方便干脆直接限制医学检验类的报考。
总之，原则上你的情况是可以报考的。少数地方不让报考的话，找个关系应该也也能通过审核。

另外补充下，本人医学检验五年制本科毕业，已经通过执业医师考试，尚未注册。临床硕士在读中