根据以上职责调整，市卫生局（市中医管理局）的主要职责是：
（一）贯彻执行国家、省、市有关卫生工作的方针政策和法律、法规、规章，起草有关地方性法规、规章草案；会同有关部门推进医药卫生体制改革；拟订全市卫生发展战略、规划和政策并组织实施。
（二）规划和协调全市卫生资源配置，指导区域卫生规划的编制和实施。
（三）牵头制定农村卫生发展规划和政策措施并组织实施，参与城乡居民医疗保险管理工作。
（四）拟订妇幼卫生、社区卫生发展规划和政策措施，指导社区卫生服务体系建设，监督管理妇幼保健、社区卫生工作。
（五）负责全市疾病预防控制工作，制定对危害人群健康的严重疾病及重大疾病的防治规划和措施并组织实施；制定全市免疫规划和政策措施并组织实施；会同有关部门对重大疾病实施防控与干预;负责法定报告传染病疫情信息的报送工作。
（六）负责卫生应急工作，制定卫生应急预案和政策措施并组织实施；负责突发公共卫生事件监测预警和风险评估；指导突发公共卫生事件预防控制与应急处置；发布突发公共卫生事件应急处置信息。
（七）贯彻执行国家促进中医药、民族医药事业发展的法律法规，起草有关地方性法规、规章草案和政策；制定中医事业中长期发展规划并组织实施。
（八）负责全市卫生行政执法工作，按照职责分工监督管理职业卫生、放射卫生、环境卫生和学校卫生，监督管理公共场所和饮用水的卫生安全及传染病防治工作。
（九）负责全市医疗机构和医疗服务的行业监督管理；监督医疗机构执行医疗服务、医疗技术、医疗质量和采供血机构管理的政策、规范、标准；监督医疗机构执行医疗卫生职业道德规范，建立健全全市医疗机构医疗服务评价和监督体系；依法监督管理血站、单采血浆站的采供血及临床用血质量；负责公民献血的日常管理工作。
（十）贯彻实施国家药品法典、国家基本药物制度和国家基本药物目录及国家药物政策；贯彻落实省基本药物采购、配送、使用的政策措施以及基本药物目录内药品生产的鼓励扶持政策。
（十一）组织制定全市卫生科技发展规划，指导卫生科技成果转化和推广应用；组织实施国家、省、市重点医药卫生科研攻关项目；参与制定考试界发展规划，组织开展继续考试界和毕业后考试界工作。
（十二）组织拟订全市卫生人才发展规划，指导卫生人才队伍建设；会同有关部门制定卫生专业技术人员资格标准并组织实施。
（十三）组织指导卫生方面的国际交流合作与卫生援外有关工作，组织开展与港澳台地区的卫生交流与合作。
（十四）承担市爱国卫生运动委员会办公室的日常工作。
（十五）承办市政府公布的有关行政审批事项。
（十六）承办市委、市政府交办的其他事项。