行政单位和事业单位应其性质不一样，所以在很多方面是存在着区别的。行政单位会计与事
业单位会计的区别主要表现在以下几个方面：
（一）行政单位会计与事业单位会计收入来源与核算的区别
行政单位的收入是指行政单位为开展业务活动，依法取得的非偿还性资金，包括拨入经费、预算外资金收入和其他收入。行政单位拨入经费的取得应当按照单位预算和用款计划申请，同时结合各项业务活动的执行情况的进度、资金的结余情况，应该按规定用途来申请，按预算级次申请取得拨入经费。为核算拨入经费，行政单位应当设置“拨入经费”总账科目，收到拨入经费时借记“经费支出”“零余额账户用款额度”“银行存款”等科目，贷记该科目；缴回拨入经费时，借记该科目，贷记“银行存款科目”；年终结账将该科目贷记余额转入“结余”科目时，借记该科目，贷记“结余”科目。该科目平时贷方余额，表示拨入经费的累计数。该科目应按拨入经费的用途和资金管理要求分别设置“基本支出”和“项目支出”两个二级科目。银行转来的收款通知书时，确认拨入经费，同时借记银行存款，贷记拨入经费，并将具体情况登记在拨入经费明细账的贷方。有财政政府性基金预算拨入经费拨入情况下拨入经费取得时，行政单位应当借记零余额用款额度，贷记拨入经费。行政单位的拨入经费平时不结转，在年终时才结转。因此“拨入经费”总账科目平时的余额，反映行政单位年度预算的执行情况或执行进度。预算外资金是指财政部门按规定从财政预算外资金专户核拨给行政单位的预算外资金以及部分经财政部门核准不上缴财政预算外资金财政专户，二直接由行政单位按计划使用的预算外资金。为核算预算外资金，行政单位应设置“预算外资金收入”总账科目。
事业单位的收入渠道比较多，有财政补助、上级补助、业务活动、附属单位交款以及一些其他收入。财政补助收入是指事业单位按核定的预算和经费领报关系从财政部门或通过主管部门从财政部门取得的各类事业经费。为核算财政部门收入业务，事业单位应设置“财政补助收入”增长科目，事业单位收到财政补助时，借记“零余额用款额度”、“事业支出”、“银行存款”等科目，贷记该科目；缴回财政补助收入时，作相反的会计分录；年终结账将该科目贷方余额全数转入“事业结余”科目时，借记该科目，贷记“事业结余”科目。该科目平常贷方余额表示财政补助收入的累计数。年终结账后，该科目无余额。事业单位在开展也活动中取得的收入包括事业收入和经营收入。