事业单位自收自支和全额财政拨款的区别在于资金来源和使用方式。

自收自支的事业单位主要依靠自身经营收入来维持运转，不依赖于政府财政拨款。自收自支的事业单位相对独立，有更大的自主权和自主决策权。但是，自收自支的事业单位需要自行负责运营和管理，经营风险和压力较大。

全额财政拨款的事业单位则主要依靠政府的财政拨款来维持运转，具有较高的稳定性和安全性。但是，全额财政拨款的事业单位相对于自收自支的事业单位，政府对其的管理和监督更加严格，自主权和自主决策权相对较低。

总之，自收自支和全额财政拨款的事业单位各有优缺点，需要根据具体情况选择合适的经营模式。