对于破产费用和共益债务的清偿，可以划分为以下几个层次：
（1）随时清偿
根据《中华人民共和国破产法》的规定，破产费用和共益债务由债务人财产随时清偿。这里随时清偿是指可以不按照破产程序中的清偿程序进行清偿。破产费用和共益债务的清偿不用列入破产财产分配表，管理人可以随时由破产财产预支或者拨付。之所以要随时清偿，目的是保证破产程序的顺利进行，也可以使管理人和人民法院了解债务人财产的支付能力，从而决定案件是否应该审理下去。
（2）按顺序或者比例清偿
根据《中华人民共和国破产法》的规定，债务人财产不足以清偿所有破产费用和共益债务的，先行清偿破产费用。债务人财产不足以清偿所有破产费用或者共益债务的，按照比例清偿。
从该规定可以看出，破产费用的清偿优先于共益债务，在债务人财产不能全部清偿所有的破产费用和共益债务时，应该先清偿破产费用，这是考虑到，当人民法院裁定受理破产案件后，就进入了破产程序，要使破产程序顺利进行，首先要保证破产费用能够得到清偿，否则，破产案件将无法再进行下去。
如果债务人财产用于清偿破产费用后，余下财产不能完全清偿共益债务的，只能就已经发生的共益债务项目，按照一定的比例进行清偿。
（3）因不能清偿导致破产程序的终结
根据规定，债务人财产不足以清偿破产费用的，管理人应当提请人民法院终结破产程序。人民法院应当自收到请求之日起15日内裁定终结破产程序，并予以公告。实际上，当不能清偿破产费用时，案件已经无法再进行审理，因此管理人应当提请人民法院终结破产程序。
下面针对以上有关破产费用和共益债务的清偿规定进行举例：
例如：人民法院受理了某国有企业的破产案件，后经管理人确认，其破产费用合计为150万元。共益债务合计为400万元（其中欠A企业100万元、B企业300万元），此时可以分为以下三种情形：
（1）假设债务人财产为1000万元，那么该1000万元可以同时清偿破产费用和共益债务，剩余的450万元用于职工工资、税款和普通债权的清偿。
（2）假设债务人财产只有200万元，那么优先清偿破产费用150万元，剩余的50万元用于清偿共益债务，由于不足以清偿全部的共益债务，按照规定，应该按照比例清偿，即：清偿率为50/400×100％＝12.5％，清偿A企业100×12.5％＝12.5（万元）；清偿B企业300×12.5％＝37.5（万元）。
（3）假设债务人财产只有100万元，此时不足以清偿破产费用，根据规定，应该由管理人申请人民法院裁定终结破产程序，破产程序终结后，该100万元的财产按照比例清偿的办法支付相应的破产费用。