首先，对于您的二级建造师注册证被原公司扣留的问题，这确实是一个比较棘手的情况。以下是一些建议帮助您解决这个问题：

1. **沟通协商**：
- 首先，建议您与原公司进行沟通，了解公司扣留证件的具体原因。可能是由于离职手续未办理完善，或者公司有一些特殊情况需要您配合解决。
- 如果是报名费由公司承担，可能公司会要求您在一定时间内为公司服务。您需要查看当初的协议内容，确认双方的权利与义务。

2. **查看合同及协议**：
- 查看您与公司签订的劳动合同或者任何相关的协议，看是否有关于注册证件归属问题的规定。
- 如果合同或协议中有明确规定，应按照约定执行。如果没有规定，您可以更有理有据地向公司提出归还注册证的要求。

3. **劳动仲裁**：
- 如果沟通协商无果，您可以向当地的劳动仲裁部门申请仲裁。劳动仲裁是解决劳动争议的一种有效途径。
- 在申请仲裁之前，准备好所有相关的证据，包括但不限于劳动合同、支付凭证、沟通记录等。

4. **法律途径**：
- 如果劳动仲裁不能解决问题，您还可以通过法律途径，即向人民法院提起诉讼，要求公司归还注册证。

5. **行业协会或主管部门**：
- 您也可以咨询相关的行业协会或政府主管部门，如住房和城乡建设部门，了解是否有专门的解决途径。

6. **预防措施**：
- 对于未来，建议在入职和离职时，特别关注注册证件的归属和使用问题，并尽量在合同中明确。

最后，请记住，在处理这类问题时，保持冷静和专业，遵循法律和合同的规定，通常都能够找到合理的解决方案。希望以上建议能够帮助到您。