尊敬的提问者，关于您在2009年首次报考二级建造师证书时有一门科目未通过的情况，以下是我的回答：

1. 重考流程：
- 首先，您需要确认当地建设行政主管部门发布的最新报考条件和报名时间。
- 准备好相关材料，如身份证、学历证明、首次考试的成绩单等。
- 在规定的时间内完成网上报名，并根据要求进行缴费。
- 报名成功后，您可以根据个人情况制定复习计划，重点攻克未通过科目的知识点。
- 参加考试，争取一次性通过。

2. 建议和注意事项：
- 分析首次考试未通过的原因，是因为复习不充分还是考试技巧欠佳，有针对性地进行调整。
- 制定切实可行的复习计划，合理分配时间，确保各科目均衡复习。
- 可以参加培训班或请教有经验的考生，了解考试重点和难点。
- 做好心理调适，保持良好的心态，积极面对考试。
- 注意查看当地建设行政主管部门的通知，以免错过重要的报考信息。

希望我的回答能对您有所帮助，祝您在下次考试中顺利通过！如有其他问题，请随时提问。