首先，关于二级建造师和C类安全员是否必须注册在同一家公司的问题，答案是：不一定必须注册在同一家公司。

以下是详细的解释：

1. 二级建造师注册：根据我国相关法律法规，二级建造师需要在具备相应资质的建筑施工企业或者其他单位注册，才能从事相关的执业活动。这意味着二级建造师需要注册在一家具有相应资质的公司，但并不要求这家公司与C类安全员注册的公司是同一家。

2. C类安全员注册：C类安全员主要负责企业的安全生产管理工作，其注册同样需要在具备相应资质的单位进行。但与二级建造师不同，C类安全员的注册公司可以是独立于二级建造师注册公司的另一家单位。

总结以下两点：

a. 二级建造师和C类安全员的注册单位可以不是同一家公司，但都需要在具备相应资质的单位进行注册。

b. 为了确保企业在项目实施过程中的合规性，建议二级建造师和C类安全员在注册公司时，充分考虑公司之间的合作关系，以便更好地协同工作。

通过以上解释，希望提问者能够完全理解并解决这个问题。如有其他疑问，请随时提问，我会竭诚为您解答。谢谢！