根据我国《公司法》等相关法律法规，另类子公司作为独立法人，是可以设置管理机构的。以下是详细的解释：

1. 首先，另类子公司是指以承担特定业务或项目为目的，由一个公司（母公司）设立的全资子公司或控股子公司。这类子公司在法律上具有独立的法人地位。

2. 根据《公司法》第三十七条规定，公司应当设立董事会、监事会和经理等管理机构。另类子公司作为公司的一种形式，也需要按照这一规定设置相应的管理机构。

3. 然而，在实际操作中，另类子公司的管理机构可能会根据其业务特点、规模和母公司的要求进行调整。例如，一些小型另类子公司可能会简化管理机构，仅设立执行董事、监事等必要职位。

4. 需要注意的是，即使另类子公司设置的管理机构与其他公司有所不同，也应当确保其管理机构的设置符合《公司法》等相关法律法规的要求，以确保公司的合法合规运营。

综上所述，另类子公司是可以设置管理机构的，但在实际操作中可以根据公司业务特点进行调整，前提是符合法律法规的规定。

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