监理工程师应该采取以下措施来处理钢材质量问题：

1. 立即通知施工方停止使用有质量问题的钢材，并要求其更换。

2. 联系钢材供应商，要求其提供有关钢材质量的检测报告和证明文件，以确认钢材是否符合标准要求。

3. 对所有的钢材进行抽样检测，确保其质量符合相关标准要求。

4. 对施工方和钢材供应商进行严格的监督和管理，确保他们遵守相关的质量标准和规定。

5. 在监理报告中详细记录钢材质量问题的处理过程和结果，以便后续的验收和审查。

这些措施可以确保钢材质量问题得到及时有效的处理，保障工程的质量和安全。同时，监理工程师的职责也包括监督工程的整个过程，确保其符合相关标准和规定。