首先，关于会计从业资格证书申请表上的单位公章是否可以盖别的单位，这通常是不被允许的。会计从业资格证书申请表上的单位公章应当是申请人所在单位的公章，以保证申请材料的真实性和有效性。如果盖了非所在单位的公章，可能会被视为提供虚假材料，从而影响到资格证书的申请。

至于财政局是否会查保险等档案，财政部门在审核会计从业资格证书申请时，主要会关注申请材料的真实性、完整性和是否符合申请条件。一般来说，财政局可能会对申请人的工作经历、教育背景等进行核实。至于保险等档案，通常不是主要的审查内容，但如果发现申请材料中有疑点或者需要进一步核实的情况，财政局是有权对所有相关档案进行审查的。

以下是针对您问题的详细解答：

1. 单位公章必须是与申请人有正式劳动合同关系的单位公章，不能使用其他单位的公章。

2. 财政局在审查会计从业资格证书申请时，会根据需要决定是否查看保险等档案。一般情况下，如果申请材料齐全、真实，不需要担心这方面的问题。

请您在填写申请表时，务必遵守相关规定，确保申请材料的真实性和有效性。如果有其他疑问，也可以咨询当地的财政局或者相关部门，他们会提供更具体的指导。

希望我的回答能对您有所帮助，祝您申请顺利！