1、转让的客体不同。

资产转让的客体为资产，股权转让的客体为股份。

2、来源不同。

资产来源于三个方面，即股东(出资人)对于公司投入的资本金、公司在生产经营过程中积累的和通过举债所获得的资金来源。

股权则不同，它只存在于公司中，不是公司制企业就不存在股份。

3、交易的主体不同。

资产的所有者是公司，股权的所有者是股东。

4、是否需要缴纳增值税不同。

一旦转让活动被认为是资产转让，就应缴纳增值税，而如果被认定为股权转让，则不需缴纳增值税。

5、获得的权利不同。

资产收购获得是对企业全部资产的实质性经营权，即资产收购交易完成后，收购企业对向被收购企业已收购的固定资产、无形资产存货、存货等可直接或派人组织实施生产经营活动，并对所经营的资产享有绝对的处置权。

而股权收购购买的是对被收购企业资产的拥有或控制权，收购企业不直接参与被收购企业的生产经营活动，对其财产也没有直接的处置权。

6、承担风险的方式不同。

资产收购完成后收购企业直接组织或参与被收购企业的生产经营活动，承担和处理发生或可能发生的一切风险活动，如采购风险、销售风险、资产储备风险、运输风险、决策风险、投资风险、纳税风险等等。

股权收购只承担投资收益风险，在投入的人力、物力和财力上也远远不如实施资产收购的企业。

7、在利益分配中所处的地位不同。

资产收购完成后收购企业是被收购企业的经营者和管理者，同时也是被收购企业经营成果的直接分配者，而股权收购完成后，收购企业不直接参与管理，除持股比例达到一定比例并出任董事长外，一般均是被动地接受经营成果的分配。

8、会计核算运用的科目不同。

对于资产收购不论是采取股权支付、还是非股权支付或者采用两者相结合的支付方式，对收购的资产都应按资产收购清单中的交易资产名称设置会计科目进行核算。

而股权收购不论是采取股权支付、还是非股权支付或者采用两者相结合的支付方式，对收购的股权一律通过“长期股权投资”科目核算。

所缴的税种区别：

股权转让需要交的税：

增值税：免缴。此行为属于非增值税征税范围。

企业所得税：转让方按股权转让收益的原则纳税。

土地增值税和契税：不缴土地增值税，因为不属于转让不动产行为。不缴契税

资本转让需要交的税：

增值税：①符合转让企业全部产权的条件时，不缴纳增值税。②不符合转让企业全部产权条件时应税货物的转让，要缴纳增值税。

企业所得税：需区分整体资产转让还是非整体资产转让两种情况。

在整体资产转让时，①如果接受企业支付的交换额中，非股权支付额不高于所支付的股权的票面价值20%的，转让企业可暂不计算确认资产转让所得或损失。②否则转让企业须计算确认资产转让所得或损失。企业以经营活动的部分非货币性资产对外投资，应在投资交易发生时，将其分解为按公允价值销售有关非货币性资产和投资两项经济业务进行所得税处理，并按规定计算确认资产转让所得或损失。

土地增值税和契税：转让房屋要涉及土地增值税问题，受让方要涉及契税问题。