菏泽医学专科学校的前身是1950年经国务院批准建立的平原省卫生学校;1958年,更名为菏泽地区医学专科学校,后又历经山东省菏泽地区卫生学校、山东省菏泽地区医学专科学校、山东省菏泽地区卫生学校等办学时期;1978年经国务院批准,更名为菏泽医学专科学校。
截至2019年3月,菏泽医学专科学校占地面积70.81万平方米,建筑面积为33.6万平方米,固定资产总值7亿余元,教学仪器设备总值9847.36万元;共建有12个教学单位,开设高职专科专业12个;共有专任教师564人,在校生13524人
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