一般来说，建筑工程一切险及第三者责任险确实应由总承包单位负责办理。以下是详细的解释：

1. **建筑工程一切险**：这种保险主要保障建筑工程过程中可能发生的各类意外损失，如自然灾害、意外事故等。由于总承包单位对整个工程有全面的控制和责任，因此通常由他们来办理这一保险。

- **理由**：总承包单位通常负责整个工程的管理和施工，对工程的风险有更全面的了解，更有能力选择合适的保险范围和保额。

2. **第三者责任险**：这种保险主要是为了保障在施工过程中可能对第三方（如过路行人、周边建筑物等）造成的损害而设置的责任保险。

- **理由**：总承包单位作为工程的主要承担方，对于施工过程中可能对外界造成的影响负有直接责任，因此办理第三者责任险是他们的职责。

3. **相关规定**：根据我国相关法律法规，如《建筑法》和《建设工程安全生产管理条例》，总承包单位有责任保障工程的安全和质量，这也包括了购买相应的保险。

4. **实际操作**：在实际操作中，总承包单位通常会根据合同要求和相关法律法规，办理相应的保险。但在某些情况下，业主也可能要求参与保险的办理或提出特定的保险要求。

5. **注意点**：购买保险时，总承包单位应与保险公司充分沟通，确保保险范围和保额能够覆盖工程的风险，以避免因保险不充分而造成的经济负担。

综上所述，建筑工程一切险及第三者责任险由总承包单位办理是合理的，也是符合我国相关法律法规的。

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