要正确处理存入保证金并开具银行承兑汇票的会计分录，你需要按照以下步骤操作：

1. 存入保证金：
- 借：其他应收款——保证金（或特定对方账户） 5,000,000元
- 贷：银行存款 5,000,000元

这一分录反映了公司将500万元存入银行作为开立承兑汇票的保证金。

2. 开具银行承兑汇票：
- 借：应付票据 5,000,000元
- 贷：承兑汇票保证金 5,000,000元

此分录表示公司开出了500万元的银行承兑汇票，并且这笔款项将由银行在未来某个时点支付。

以下是每个步骤的详细解释：

- **借：其他应收款——保证金**：这一账户反映了公司暂时存放于银行的资金，用作开具承兑汇票的保证金。
- **贷：银行存款**：这一分录表示公司的银行存款因存入保证金而增加。
- **借：应付票据**：此账户代表公司对外开具的承兑汇票，是一种短期负债。
- **贷：承兑汇票保证金**：这一项反映了与承兑汇票相对应的保证金，保证了银行在汇票到期时的支付义务。

请注意，会计分录需根据企业的具体会计政策和实际业务情况来制定，上述分录仅提供一种标准的处理方法。在实施会计分录前，建议与会计专业人士或审计师进行沟通，确保所有会计处理都符合当前会计准则和法规要求。

希望以上回答能够帮到你，如果还有其他疑问，欢迎继续咨询。我会耐心为您解答。