尊敬的提问者，关于消防工程公司资质申报的问题，以下是根据我的了解和检索到的信息给出的详细回答：

首先，为什么有些人说消防工程公司现在可以直接申报二级资质？

1. 政策变动：我国相关部门为了鼓励和支持消防工程行业的发展，有时会对资质申报政策进行调整。在某些情况下，如果满足特定条件，确实可能允许企业直接申报二级资质。

2. 特定条件：如企业具备一定的业绩、技术力量、专业人员等，可能符合直接申报二级资质的要求。

然后，为什么又有一部分人说还是要从三级资质申报起？

1. 资质申报的一般流程：通常情况下，消防工程公司需要从三级资质开始，逐步积累业绩、提高技术实力和专业人员配置，然后才能申报更高等级的资质。

2. 政策要求：不同地区和时期的政策可能有所不同，部分地区可能仍然要求企业按照从低到高的顺序逐级申报资质。

总结：

1. 请注意，具体的资质申报政策可能会因地区、时间以及企业自身条件的不同而有所差异。建议您关注当地相关部门发布的最新政策。

2. 若想了解确切情况，建议向当地消防工程行业协会或相关部门咨询，以获取最准确的信息。

在此，希望我的回答能够帮助您解决问题。如有其他疑问，请随时提问。祝您工作顺利！