药学有2种考试形式：1、是执业资格考试（执业药师），2、是职称考试（药师—主管药师—副主任药师—主任药师）。
1、执业资格考试（执业药师）是属于职业资格准入考试，有人事部、国家药监局共同负责，实行全国统一大纲，第一命题，统一组织的考试制度。每年举行一次，报名时间为每年的3月，考试时间为每年10月。执业药师相当于职称考试的主管药师的级别。有关报考执业药师的具体事宜在网上都能搜索得到。
2、职称考试，要从初级开始考，顺利的话，每5年晋升一档，除了参加考试合格以外，还要有论文发表，晋升越高级的职称，对论文的要求就越高。职称晋升考试是各地省级卫生厅和省级药监局负责的。但是卫生厅对参加职称考试的专业和所从事的工作性质要求很严格。

根据你的情况“生物制药专业毕业，入职一家医药公司”如果想考卫生系统的职称是不可以的了。
你“09年生物制药毕业”，本科学历工作3年（大专5年），就可以考执业药师。
当然也可以考省药监局的药师职称。具体要求以及报名时间和考试时间等详细事宜，可以在当地省食品药品监督管理局网站看通知，或者到当地市食品药品监督管理局人事教育科咨询。