您好！关于您的问题，五年一贯制大专临床医学专业的毕业生在考取执业医师资格证书后，是可以注册在市级医院及州级医院的。但具体注册的条件和要求，可能因地区政策和医院规定而有所不同。以下是详细解答：

1. 执业医师资格：首先，您需要通过国家统一的执业医师资格考试，取得执业医师资格证书。

2. 注册条件：根据我国相关法规，执业医师注册需满足以下基本条件：
- 拥有中华人民共和国国籍；
- 取得执业医师资格证书；
- 在医疗机构从事相应的临床工作；
- 遵守国家法律法规，具有良好的职业道德。

3. 地域限制：一般情况下，执业医师在全国范围内都是可以注册的。但在实际操作中，市级和州级医院可能会对注册医师的学历、专业、工作经验等有所要求。

4. 医院级别：市级和州级医院通常对应二级以上医院。五年一贯制大专临床医学专业毕业生在满足注册条件后，理论上可以在这些医院注册。

5. 注意事项：
- 各地政策不同，具体注册条件和程序可能会有所差异，建议您咨询当地卫生行政部门或医院了解详细信息；
- 在实际操作中，医院可能会优先考虑学历较高、经验丰富的医师，因此，五年一贯制大专毕业生在竞争中可能存在劣势；
- 提升自己的专业能力和实践经验，有助于提高在市级和州级医院注册的机会。

希望以上回答对您有所帮助，如有其他疑问，请随时提问。祝您工作顺利！