您好！关于您的问题，机械设计制造及其自动化专业的毕业生是可以报考市政二级建造师的。但具体是否具备报考资格，还需参考以下条件：

1. 教育背景：机械设计制造及其自动化专业属于工程类专业，而市政二级建造师报考条件一般要求具有工程类或工程经济类中等专科以上学历。

2. 工作经验：根据我国相关政策，报考市政二级建造师需要具备一定的工作经验。具体要求如下：
- 具有工程类或工程经济类中等专科以上学历，并从事建设工程项目施工管理工作满2年；
- 具有建设工程项目施工管理工作满5年经验的人员，可放宽至高中学历。

3. 专业相关性：虽然机械设计制造及其自动化专业并非直接对应市政工程，但在实际工作中，如果您的专业知识和技能与市政工程有一定关联，例如在机械设备和自动化控制方面有涉及，那么您报考市政二级建造师的可能性会更大。

4. 考试内容和要求：市政二级建造师考试内容包括专业知识、法律法规、工程实践等。您需要了解并掌握相关考试内容，以便顺利通过考试。

总之，在满足以上条件的前提下，您可以尝试报考市政二级建造师。在报名前，建议您仔细阅读当地相关部门发布的报考指南，了解具体的专业要求和考试条件，确保自己符合报考资格。

希望以上回答对您有所帮助，如有其他问题，请随时提问。祝您考试顺利！