您好！这个问题涉及到财务报表中的内部交易，也就是关联交易对净利润的影响。

首先，乙公司2016年实现的净利润2000万包含了公司所有的经营成果，但是根据会计准则，如果乙公司与甲公司之间发生了内部交易，那么甲公司卖商品给乙公司所获得的利润是需要从乙公司的净利润中扣除的。

原因如下：

1. **避免重复计算**：如果乙公司购买的甲公司商品中包含的利润不被扣除，那么实际上是将甲公司的利润算作了乙公司的利润，这会导致利润的重复计算。

2. **反映真实经营状况**：内部交易往往不反映市场的真实供求关系，因为这种交易的价格可能并不是公允的。为了使财务报表能够更真实地反映乙公司的经营成果，需要将这部分利润剔除。

3. **符合会计准则**：根据我国的会计准则和税法，关联方交易需要按照公允价值进行调整，以确保财务报表的真实性和合规性。

至于您问乙年底实现的净利润有没有包含这笔内部交易，答案是**包含**的。但在编制财务报表时，需要调整处理，具体步骤如下：

- 首先，乙公司按照常规计算出总的净利润。
- 然后，在编制合并报表时，将甲公司卖商品给乙公司所获得的利润从乙公司的净利润中扣除。
- 最终，报表中呈现的将是扣除内部交易影响后的净利润。

这样的处理能够确保投资者和其他财务报告使用者得到的信息是经过调整，反映了乙公司真实的经营状况。

希望这个解释能够帮助您明白内部交易对净利润的影响，如果还有其他问题，请随时提问。我会尽力为您解答。