首先，通过自学考试获得本科证书的学生在报考研究生时，整体上是享有同等的报考权利的。但是，需要注意以下几点限制：

1. 学历认证：部分院校可能在研究生报考条件中要求考生具有全日制本科及以上学历。这种情况下，自学考试取得的本科证书虽然国家承认，但可能不满足某些院校的具体要求。因此，考生在报考前需详细查阅目标院校的招生简章，了解具体认证标准。

2. 报考条件：部分专业对考生的前置学历有特定要求，例如医学、法律等专业，可能会要求考生具有相关专业背景。如果自学考试的本科专业与考研专业不符，可能需要通过额外的课程或考试来弥补这一差距。

3. 成绩要求：部分院校或专业可能对自学考试成绩有一定的要求，如平均分、单科成绩等。考生在报考前应确保自己的成绩符合目标院校的要求。

4. 考研科目：自学考试的学生在考研时，需要参加全国硕士研究生入学统一考试，考试科目与全日制本科毕业生相同。但部分院校可能对自考生有额外的考试要求，如加试等。

以下是针对提问者的详细解答：

1. 确认目标院校和专业：详细查阅目标院校的招生简章，了解报考条件，确认自己的学历是否符合要求。

2. 咨询院校研究生招生办：如有疑问，可直接联系目标院校的研究生招生办公室，了解自学考试本科证书在报考该校研究生时的具体政策。

3. 准备额外材料：如果自学考试的本科专业与考研专业不符，提前准备相关证明材料，如课程成绩单、相关工作经验等，以便在报名时提交。

4. 提前规划：由于可能存在额外的报考限制，自学考试的学生应提前规划考研事宜，确保有足够的时间准备。

总之，通过自学考试取得本科证书的学生在考研时，虽然可能面临一定的限制，但只要提前了解、充分准备，仍然有机会实现研究生梦想。祝您考研顺利！