在面对管理层凌驾于内控之上的情况时，注册会计师应当实施以下审计程序：

1. 了解和评估内部控制系统：
- 评估公司的内部控制政策，以确定其是否足以防止和检测错误和欺诈行为。
- 了解管理层对内控的态度和做法，判断其是否凌驾于内控之上。

2. 实施实质性测试：
- 对关键账户和交易进行详细的实质性测试，以获取审计证据，确认管理层凌驾于内控之上的影响。
- 包括对重要财务报表项目的核对、分析和计算等。

3. 加强审计程序：
- 在风险评估的基础上，针对管理层凌驾于内控之上的风险，加强审计程序，如增加样本量、扩大审计范围等。
- 对可能受到管理层影响的关键环节进行重点关注。

4. 独立性评估：
- 评估注册会计师自身的独立性，确保在审计过程中能够保持客观、公正的态度。
- 如有需要，可以向第三方专业机构咨询意见，以增强独立性。

5. 沟通与披露：
- 与管理层沟通，了解其凌驾于内控之上的原因，评估其对财务报表的影响。
- 在审计报告中充分披露管理层凌驾于内控之上的事实，以及对审计意见的影响。

6. 审计结论：
- 根据审计证据，判断管理层凌驾于内控之上对财务报表的影响程度。
- 根据影响程度，出具适当的审计意见。

通过以上审计程序，注册会计师可以确保在面对管理层凌驾于内控之上的情况时，仍能保持审计的准确性和合规性。希望这些信息对您有所帮助，如有其他疑问，请随时提问。祝您工作顺利！