您好！针对您的问题，我将为您逐一解答：

1. **初始成本的定义**：
初始成本通常指的是在获取资产或服务时，直接与获取过程相关的成本。在租赁业务中，初始成本可能包括租赁资产的改良费用、租赁手续费等。在您提到的案例中，甲公司发生的5000元成本，如果是在租赁开始前发生，且与租赁资产的获取或准备使用直接相关，那么它可以被认定为初始成本。

2. **初始成本与租金付款的关联**：
初始成本是否计入租金付款净额，取决于会计准则和具体业务的判断。在《企业会计准则》中，通常要求将与租赁资产获取和使用直接相关的初始直接费用计入租赁负债的初始计量中。这意味着，如果这些成本是对租赁资产必要的支出，它们应当计入租金付款净额中。

3. **一般费用与初始成本的区分**：
- **一般费用**：通常是指企业在日常运营中产生的费用，比如管理费用、销售费用等，它们与特定资产的获取或生产无关，是周期性或偶然发生的。
- **初始成本**：如前所述，是与获取资产直接相关的成本，通常在租赁或购买资产时发生。

区分这两者的关键在于成本的发生是否与资产的获取或生产直接相关，以及这些成本是否属于获取资产过程中的必要支出。

以下是一个具体的区分方法：

- 如果费用是在租赁期开始前支付的，且是为了让租赁资产达到可使用状态而发生的，那么它通常是初始成本。
- 如果费用是在租赁期间或之后支付的，且是为了维护资产或日常运营而产生的，那么它就是一般费用。

希望以上解答能够满足您的需求，如果您还有其他问题，欢迎继续咨询！祝您工作愉快！