以下是上海浦东新区和南汇区的一些预算员培训机构：

1. 上海财经大学继续教育学院：提供预算员职业资格证培训课程，包括预算员基础、预算编制与控制、预算分析与决策等方面的培训。

2. 上海市财经职业技术学院：该学院开设有会计预算师职业资格证培训课程，包括预算编制与控制、财务分析与决策、预算管理等方面的培训。

3. 上海市预算管理培训中心：该中心是上海市财政局下属的培训机构，提供预算管理培训、财务管理培训、会计实务培训等课程。

4. 上海市南汇区职业技术培训中心：该中心提供预算员职业资格证培训课程，包括预算编制与控制、财务分析与决策、预算管理等方面的培训。

以上是一些在上海浦东新区和南汇区的预算员培训机构，具体选择可以根据自己的需求和预算进行考虑。