您好！注册一个三级资质的消防工程公司，需要遵循以下流程和注意事项：

1. 企业名称预先核准
- 首先，您需要到当地的市场监督管理局进行企业名称预先核准。确保您的公司名称符合《企业名称登记管理规定》，且不与他人在先取得的名称相同或相似。

2. 准备资质申请材料
- 根据《建筑业企业资质管理规定》，申请三级消防工程资质所需材料包括：
a. 企业法人营业执照副本复印件
b. 法定代表人的身份证复印件
c. 技术负责人的身份证、学历证明、职称证明复印件
d. 注册资本、专业技术人员、技术装备等证明材料
e. 企业安全生产许可证等相关材料

3. 提交资质申请
- 将准备好的资质申请材料提交至当地住房和城乡建设主管部门。注意：需确保所有材料真实、完整、准确。

4. 等待资质审核
- 住房和城乡建设主管部门将按照规定对您的资质申请进行审核。审核通过后，会发放《建筑业企业资质证书》。

5. 办理其他相关手续
- 取得资质证书后，还需要办理以下手续：
a. 税务登记
b. 开设企业基本账户
c. 社保开户
d. 统计登记等

6. 注意事项
- a. 确保企业具备相应的注册资金、专业技术人员、技术装备等条件。
b. 关注当地政策，了解消防工程资质的最新动态。
c. 办理过程中，保持与住房和城乡建设主管部门的沟通，及时了解审核进度。

希望以上回答对您有所帮助。祝您注册顺利，事业发展壮大！如有其他问题，请随时提问。