尊敬的老师，您好！

在计算建筑高度时，确实需要考虑屋顶上的辅助用房。根据规定，如果辅助用房的建筑面积不大于屋顶面积的1/4，那么这部分高度可以不计入整个建筑的高度。

对于屋顶上有多个辅助用房的情况：

1. 应将各辅助用房的建筑面积之和与屋顶总面积进行比较。如果这个总和不超过屋顶面积的1/4，那么所有辅助用房的高度都不计入整体建筑高度。

2. 如果辅助用房的建筑面积之和大于1/4的屋顶面积，则需要将这部分高度计入建筑总高度。至于高度的计算方式，原则上应该按照最高的辅助用房来确定。这是因为辅助用房的存在会影响建筑的整体外观和结构，特别是最高的辅助用房可能会对周围环境、日照等因素产生较大影响。

3. 当辅助用房高度不一致时，确实应按照最高的辅助用房来确定建筑高度。这样做能更准确地反映建筑的实际高度和对周边环境的影响。

总结：
- 面积比较：将所有辅助用房的面积相加，与屋顶面积的1/4进行比较。
- 高度计算：如果辅助用房总面积超过1/4屋顶面积，则按最高的辅助用房计算建筑高度。

希望这个解释能够帮助您准确理解和解决问题。如果有任何疑问，欢迎继续提问，我会耐心为您解答。