您好！关于您提出的问题，我将根据我国现行的《建筑设计防火规范》来帮您分析：

首先，根据规范，一级丙类多层厂房的防火分区面积最大为6000平方米，您提到的该厂房每层面积为5625平方米，确实可以划分为一个防火分区。

其次，关于二层中间仓库面积280平方米，小于二层面积5%的问题。这里需要明确，防火分区划分不仅仅取决于面积比例，还需要满足以下条件：

1. 防火分区的划分应使建筑物在发生火灾时，不致影响其他分区或相邻建筑物。
2. 防火分区内的火灾危险性应相同。

对于仓库的设置，规范要求仓库应设置在独立的防火分区内，且仓库面积不应超过所在防火分区面积的10%。您提到的二层中间仓库面积280平方米，看似小于二层面积的5%，但如果该仓库所在的防火分区内还有其他火灾危险性较高的区域，那么这个比例就不适用。

此外，仓库的设置还需满足其他要求，如仓库与生产车间的距离、疏散通道的设置等。因此，即使面积比例符合要求，也有可能因其他因素导致不符合防火规范。

综上所述，您提到的印刷厂二层中间仓库面积虽然小于二层面积的5%，但可能存在其他原因导致不符合防火分区要求。建议您详细检查防火分区内的火灾危险性、疏散通道、仓库与车间的距离等因素，以确保符合规范要求。

希望我的回答对您有所帮助，如有其他疑问，请随时提问。祝您工作顺利！