尊敬的提问者，您好！

关于您提出的问题，“建筑屋顶辅助用房面积大于四分之一，算层数吗？”我们需要从以下几个角度来进行解答。

1. **建筑设计规范：**
根据我国现行的《建筑设计规范》（GB50096-2011），在计算建筑层数时，通常只计算主要使用功能的楼层。辅助用房，如设备层、屋顶水箱间等，一般不单独计算层数。

2. **辅助用房的定义：**
辅助用房通常指的是为整栋建筑物的正常使用提供辅助功能的房间，例如设备间、管道井、屋顶水箱间等。这类用房不直接用于居住、办公等主要功能。

3. **面积比例的影响：**
在一些地方性规定或者具体项目审批中，可能会对辅助用房的面积占屋顶面积的比例有所要求。如果辅助用房的面积超过屋顶面积的四分之一，某些地区可能会要求在计算建筑高度或层数时考虑这一因素。

但这并不意味着它会被算作一个完整的楼层。具体是否算作层数，需要参照当地的具体规定和解释。

4. **具体操作建议：**
如果您在实际操作中遇到这个问题，建议您查阅当地的建设部门规定或咨询专业建筑师。他们会根据当地的具体政策和实施标准为您提供准确的答案。

总结：

一般情况下，建筑屋顶的辅助用房面积大于四分之一并不直接算作一个完整的层数。但是，具体是否影响建筑层数的计算，还需根据当地的相关规定和建筑审批部门的要求来确定。

希望以上回答能够帮助到您，如果还有其他问题，请随时提问。祝您工作顺利！