根据我国《建筑设计防火规范》（GB50016-2014）的相关规定，甲乙类中间仓库的面积设置确实需要遵守一定的规定。以下是针对您的问题的详细解答：

1. 甲乙类中间仓库的面积是否不能大于甲乙类仓库一个防火分区的面积？

是的，根据《建筑设计防火规范》的规定，甲乙类中间仓库的面积不应大于相应类别的仓库一个防火分区的最大允许面积。这是为了确保在发生火灾时，火势能够得到有效控制和扑救，减少火灾蔓延的风险。

2. 如果中间仓库设了自喷，中间仓库的面积可以增加一倍吗？

设置自喷系统确实可以对仓库的面积产生一定的影响。根据《建筑设计防火规范》的规定，在满足以下条件时，甲乙类中间仓库的面积可以适当增加：

a. 设置了符合规范要求的自喷系统；
b. 增加的面积不得超过原防火分区最大允许面积的1.5倍；
c. 增加的面积应满足安全疏散、消防设施设置及其他相关要求。

需要注意的是，即使设置了自喷系统，中间仓库的面积也不能无限制地增加一倍。具体增加的面积需要根据实际情况和规范要求来确定。

综上所述，甲乙类中间仓库的面积设置应遵循《建筑设计防火规范》的相关规定，设置自喷系统后可以适当增加面积，但增加的面积不得超过规范要求的最大值。请您在进行设计和施工时注意遵守相关规范，确保消防安全。

祝您工作顺利！如有其他问题，请随时提问。我会尽力为您解答。