地下室设置自动灭火系统时，防火分区的面积需要按照国家相关消防标准和规定进行合理划分。以下是具体的回答：

1. 防火分区的定义：防火分区是指采用具有一定耐火极限的防火墙、楼板及其他防火分隔设施，在建筑内部按防火要求划分的局部空间。

2. 防火分区面积的规定：
- 根据《建筑设计防火规范》（GB50016-2014）的要求，地下室设置自动灭火系统时，每个防火分区的最大允许建筑面积应根据自动灭火系统的类型和性能确定。
- 通常情况下，设有自动灭火系统的地下室防火分区面积可适当放宽，但具体数值需参考当地消防部门和建筑设计规范的要求。

3. 自动灭火系统的选择：
- 地下室自动灭火系统一般选择湿式自动喷水灭火系统、干式自动喷水灭火系统或气体灭火系统等。
- 不同类型的自动灭火系统对防火分区面积的要求可能有所不同，请根据具体选用的系统类型查阅相关标准。

4. 防火分区划分的注意事项：
- 防火分区应尽量与建筑使用功能、疏散路线等相结合，避免影响正常使用和疏散。
- 防火分区之间应设置明显的防火分隔设施，如防火墙、防火卷帘等。
- 防火分区应设置独立的疏散楼梯或安全出口，确保人员安全疏散。

综上所述，地下室设置自动灭火系统时，防火分区的面积需要根据国家相关消防标准和规定进行合理划分。具体面积要求请参考当地消防部门和建筑设计规范的要求，并结合选用的自动灭火系统类型进行设计。如有疑问，建议咨询专业消防设计师或相关部门。希望以上内容对您有所帮助。祝您工作顺利！