消防工程师在注册有效期内更换工作单位是可以的，但需要遵循以下规定：

1. 提前申请：在注册有效期内，消防工程师如需更换工作单位，应提前向原注册单位提出申请，办理相关手续。

2. 办理变更手续：消防工程师在获得原注册单位同意后，需在30日内向新工作单位所在地的省级消防部门办理注册变更手续。

3. 备案：完成注册变更手续后，消防工程师需将变更信息报备至中国消防协会。

4. 注意有效期：在注册有效期内更换工作单位不会影响注册有效期，但需确保在注册有效期届满前完成新单位的注册手续。

5. 相关材料：办理注册变更手续时，消防工程师需要提供以下材料：
- 注册证书原件及复印件；
- 身份证件原件及复印件；
- 原注册单位出具的同意变更证明；
- 新工作单位的劳动合同或聘用合同。

6. 遵守规定：消防工程师在更换工作单位时，应确保遵守相关规定，以免影响自己的职业生涯。

总结：消防工程师在注册有效期内更换工作单位是可以的，但需要遵循相关规定，及时办理注册变更手续，并报备至相关部门。在更换工作单位时，应注意合同期限、材料准备等问题，确保顺利进行。如有疑问，可咨询当地消防部门或中国消防协会。

希望以上回答对您有所帮助，如有其他问题，请随时提问。祝您工作顺利！